Wollten Wissenschaftler bislang nach bestimmten DNA-Sequenzen suchen, mussten sie viele unterschiedliche Datenbanken durchstöbern und dann die jeweiligen Datensätze herunterladen. Das war lückenhaft, aufwendig und teuer. Forscher von der ETH Zürich haben nun das digitale Tool «MetaGraph» entwickelt, mit dem die Rohdaten aller in Datenbanken gespeicherten DNA- oder RNA-Sequenzen durchsucht werden können. Nachdem eine Sequenz in eine Suchmaske eingegeben wurde, erfahren sie innerhalb von Sekunden oder Minuten, ob und wo diese bereits aufgetaucht ist. Zurzeit ist knapp die Hälfte der weltweit verfügbaren Datensätze der DNA-, RNA- und Proteinen-Sequenzen von Viren, Bakterien, Pilzen, Pflanzen, Tieren und Menschen aufgenommen. Der Rest soll bis Ende des Jahres folgen. Das Besondere: «MetaGraph» steht als Open Source für alle zur Verfügung.

Quelle: ETH Zürich (Nature 2025)

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